کتاب آموزش جامع نرم افزارهای کاربردی بیوانفورماتیک نوشتهی محمود غلامی، مریم فتحالهی، سمانه بوربور، زهرا اعتمادیفر و سروش سرداری یک منبع آموزشی کامل و عملی برای بیوانفورماتیک از سطح مفهومی تا اجرای پروژههای پژوهشی است. این کتاب صرفا به معرفی مفاهیم یا نرمافزارها بسنده نمیکند، بلکه خواننده را قدمبهقدم وارد جریان واقعی تحلیل دادههای زیستی میکند.
دربارهی کتاب آموزش جامع نرم افزارهای کاربردی بیوانفورماتیک
کتاب آموزش جامع نرم افزارهای کاربردی بیوانفورماتیک با تبیین دقیق ماهیت بیوانفورماتیک و سیر شکلگیری آن آغاز میشود و نشان میدهد چگونه این رشته بهعنوان نقطه تلاقی زیستشناسی مولکولی، آمار، علوم کامپیوتر و ریاضیات محاسباتی شکل گرفته است. محمود غلامی، مریم فتحالهی، سمانه بوربور، زهرا اعتمادیفر و سروش سرداری، نویسندگان این کتاب، سپس به نقش بیوانفورماتیک در شناسایی توالیهای ژن، پیشبینی ساختار پروتئینها، مدلسازی مولکولی و کشف داروهای جدید بهصورت کاربردی تشریح میشود.
نرم افزارهای بیوانفورماتیک؛ آموزش مقدماتی تا پیشرفته
کتاب آموزش جامع نرم افزارهای کاربردی بیوانفورماتیک خواننده را نهتنها با برنامههایی مانند GenBank ،EMBL ،DDBJ ،SwissProt ،PDB ،KEGG ،OMIM و PubMed آشنا میکند، بلکه منطق ساختار داده، نحوهی ثبت توالیها، بازیابی اطلاعات، تفسیر رکوردها و ارتباط بین پایگاهها را نیز بهطور عملی میآموزد. این رویکرد نویسندگان باعث شده این کتاب به یک مرجع قابل اتکا برای پژوهشهای دانشگاهی تبدیل شود.
مباحث پیشرفتهای مانند همترازی توالیها، ویرایش و تحلیل آنها با CLC Sequence Viewer، بررسی جهشها، ترسیم و تفسیر درختهای فیلوژنتیک با MEGA و درک مسیرهای تکاملی موجودات زنده به تفصیل در کتاب آموزش جامع نرم افزارهای کاربردی بیوانفورماتیک مطرح میشود. سپس کتاب وارد حوزهی ساختار پروتئین میشود؛ از مدلسازی همولوژی و انتخاب Template و Query تا ارزیابی مدلها و کار عملی با نرمافزار Molegro، شامل visualization ،docking، تحلیل poseها و اجرای شبیهسازیهای مولکولی دقیق پیش میرود. این کتاب توسط نشر اشراقیه منتشر شده است.
کتاب آموزش جامع نرم افزارهای کاربردی بیوانفورماتیک برای شما مناسب است اگر
- دانشجوی کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری رشتههای ژنتیک، زیستشناسی مولکولی، بیوتکنولوژی، داروسازی و... هستید.
- بهعنوان پژوهشگر در حوزههای ژنتیک و تحلیل دادههای زیستی تحقیق میکنید.
- دوست دارید درخصوص بیوانفورماتیک بیشتر اطلاعات کسب کنید.
در بخشی از کتاب آموزش جامع نرم افزارهای کاربردی بیوانفورماتیک میخوانیم
از میان بسیاری از فاکتورهایی که بر روی اختصاصیت واکنش PCR مؤثر است، هیچکدام به اندازهی انتخاب پرایمر دارای اهمیت نمیباشند. انتخاب بدِ پرایمرها برای به دست آوردن محصولات ما سبب خلوص بالا میشود که تکثیر باندهای ناخواسته را مهار میکند. مسیر شدن پرایمرها به الگوی DNA نیز داده نشده و دما باید بهطور کلی بالا باشد. اتصال پرایمرها به الگوی DNA انجام میگیرد و دمای اتصال آنها بسیار حائز اهمیت است. اتصال به صورت خیلی آهسته انجام میگیرد و پرایمرها در نقاط متفاوت با شباهت مختصری به توالی مورد نظر دارند به DNA الگو متصل میگردند و در نهایت باندهای متعدد غیر اختصاصی مشاهده خواهد شد. بنابراین درجه حرارت آنیل برای اتصال پرایمرها باید به اندازه کافی پایین باشد تا اتصال پرایمرها به DNA الگو امکانپذیر سازد و از طرف دیگر به اندازه کافی بالا باشد تا از ایجاد اتصالات غیر اختصاصی جلوگیری شود. بنابراین بهترین دمای اتصال پرایمرها دمایی است که در آن محصول PCR کافی از طرف توالی الگوی مطلوب و غلظت پرایمر مناسب برای دستیابی به حداکثر ویژگی و کارایی PCR ضروری میباشد.
بله
















