بله
کتاب توالی یابی (RNA (RNA-Seq و واکاوی دادههای آن
برای خواندن کتاب توالی یابی (RNA (RNA-Seq و واکاوی دادههای آن و دسترسی به هزاران کتاب و کتاب صوتی دیگر، اپلیکیشن کتابراه را رایگان نصب کنید.
چرا کتابراه را نصب کنم؟
از رمان و روانشناسی تا کسبوکار و تاریخ؛ کتابهای الکترونیکی و صوتی را هر زمان که خواستی بخوان یا گوش کن.
کتابها را دریافت کن و هر زمان و هر جا، بدون نیاز به اینترنت به کتابخانهٔ شخصی خودت دسترسی داشته باش.
حدود ۱۰ میلیون نفر از کتابراه برای مطالعه و شنیدن کتاب استفاده میکنند و نظرات خودشون رو با دیگران به اشتراک گذاشتهاند.
تغییر فونت و اندازه متن، حالت شب، هایلایت، یادداشتگذاری و بسیاری قابلیتهای دیگر، مطالعه را راحتتر و لذتبخشتر میکنند.
معرفی کتاب توالی یابی (RNA (RNA-Seq و واکاوی دادههای آن
کتاب توالی یابی (RNA (RNA-Seq و واکاوی دادههای آن اثری کاملاً کاربردی است که در زمینهی مطالعهی ژنهای موجودات گوناگون و تحلیل دادهها شما راهنمایی میکند و اطلاعات سودمندی ارائه میدهد.
توالی یابی RNA روشی جدیدی به منظور مطالعه بیان ژن در موجودات مختلف محسوب میشود که توانایی بررسی بیان کل ژنوم یک موجود را در یک زمان فراهم میسازد. یکی از مشکلات این روش واکاوی دادههای آن است که بسیار زمانبر است و به مهارت بالای پژوهشگر نیاز دارد. کتاب «توالی یابی RNA و واکاوی داده های آن» کتابی مفید است که به زبان بسیار ساده و با کمک شکلهای با کیفیت، نحوهی واکاوی دادههای توالی یابی RNA را آموزش میدهد. در فصل اول به تعریف اصطلاحات مهم در این خصوص پرداخته شده است و در فصول بعدی نحوهی واکاوی دادهها و یافتن مسیرهای درگیر در بیان ژنها عنوان گشته است. از جمله کنترل کیفیت، مکانیابی و اسمبل کردن تا بررسیهای آماری پوشش داده شده است. هدف این بوده است که اطلاعات در این زمینه به صورت جامع و کاربردی بیان گردد و تلاش شده است مهارت کاربر و یا پژوهشگر را در این راستا بالا ببرد. با این اطلاعات محققین میتوانند تفاوت بیان ژنهای مورد نظر را بررسی کنند. گروه هدف این کتاب که اولین کتاب تالیفی در این راستا است، دانشجویان و محققین حوزه علوم زیستی در مقطع تحصیلات تکمیلی هستند.
در بخشی از کتاب توالی یابی (RNA (RNA-Seq و واکاوی دادههای آن میخوانیم:
تمامی مولکولهای RNA در باکتریها و یوکاریوتها بعد از سنتز تا حدودی دستخوش تغییراتی میشوند. در طی این فرآیند ساختمانی بعضی از آنزیمها به جای پروتئین از ساختمان RNA هستند. در واقع مولکولی که تازه ساخته میشود را ترانوشت اولیه میگویند. در مورد یک RNA پیک یوکاریوتی ترانوشت اولیه به طور شاخصی مکمل توالیهای یک ژن میباشد که ممکن است توالیهای کدکنندهی پلی پپتید در مجاورت یکدیگر قرار نداشته باشند. قطعات غیر کدکنندهای که ناحیه کدکننده ترانوشت را میشکنند را اینترون و قطعات کد کننده را اگزون گویند.
در فرآیندی به نام پیرایش اینترونها از رونوشت اولیه حذف میشوند و اگزونها به هم وصل میشوند و همچنین در دو انتهای RNA یک اعمالی انجام میگیرند که یک رشتهی تغییر یافته به نام کلاهک 5 به انتهای 5 اضافه میشود و انتهای 3 شکسته میشود و 25-8 آدنیلات به آن اضافه میشود.
فهرست مطالب کتاب
تقدیر و تشکر
پیش گفتار
مقدمه
RNA
ساخت RNA
پردازش RNA
توالی یابی با روش سنگر
تعیین توالی نسل جدید
بررسی ترانوشتها
توالی یابی RNA
استخراج RNA
کنترل کیفیت RNA استخراج شده
آماده سازی کتابخانه
اصطلاحات رایج در رابطه با روش توالی یابی RNA
فرمت دادهها
تعیین توالی از نو
تعیین توالی دو جهتی و یک جهتی
خوانش
(Flow cell (Chip, Slid
ردیف
عمق خوانش تعیین توالی
پیرایش جایگزین
نرمال کردن دادهها
عمق توالی یابی
طول اگزون
Fragments per Kilobase of exon model per Million reads mapped (FPKM)
Reads per Kilobase per Million mapped reads (RPKM)
(TPM) Transcript Per Million
ژنوم مرجع
پایگاه دادههای مرتبط با تکنیک تعیین توالی نسل جدید
انواع پلتفرم
تعیین توالی با تکنولوژی 454
تعیین توالی در تکنولوژی Illumina/Solexa
تعیین توالی با ABI/SOLiD
تعیین توالی با Ion Torrent
نسل سوم توالی یابیTo top
تعیین توالی با PacBio
فناوری نانوپور
اساس انتخاب پلتفرم
صحت توالی یابی
میزان خوانش
طول خوانش
یک یا دو جهتی بودن توالی
مقدار نمونه
واکاوی دادههای توالی یابی RNA
نرمافزار واکاوی دادههای توالی یابی RNA
نرم افزار CLC Genomics Workbench
واکاوی دادههای توالی یابی RNA با نرمافزار CLC Genomics Workbench
معرفی صفحهی اصلی
نحوهی وارد نمودن (Import) دادهها
بررسی کیفیت دادهها (QC)
بررسی گزارش گرافیکی QC
سایر گزارشهای کیفی (Supplementary QC report)
ویرایش توالیها (Trimming)
ژنوم مرجع (Reference genome )
نقشهیابی ژنها (Mapping)
دسته بندی دادهها (Set up Experiment)
واکاوی آماری (Statistical Analysis)
خروجی دادههای واکاوی آماری
بررسی بیان ژنها با استفاده از اطلاعات فایل اکسل خروجی نرمافزار CLC
فیلتر کردن اطلاعات اکسل خروجی CLC
STRING
Blast2GO
منابع
مشخصات کتاب الکترونیک
| عنوان کتاب | کتاب توالی یابی (RNA (RNA-Seq و واکاوی دادههای آن |
| نویسنده | ابوذر قربانی، مهسا رستمی، علیرضا افشاری فر، رضا آذربایجانی |
| ناشر چاپی | انتشارات مرجع علم |
| سال انتشار | ۱۳۹۹ |
| فرمت کتاب | |
| تعداد صفحات | 87 |
| زبان | فارسی |
| شابک | 978-600-826578-8 |
| قیمت کتاب الکترونیک | ۱۰۰,۰۰۰ تومان خرید کتاب الکترونیک نسخه نمونه رایگان |
| موضوع کتاب | کتابهای ژنتیک |
